Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD46P15529 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD46P15529 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD46P15529 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD46P15529 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD46P15529 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD46P15529 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD46P15529 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD46P15529 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CD46P15529 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD46P15529 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD46P15529 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD46P15529 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD46P15529 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD46P15529 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CD46P15529 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD46P15529 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD46P15529 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD46P15529 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD46P15529 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD46P15529 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD46P15529 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD46P15529 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD46P15529 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD46P15529 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD46P15529 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD46P15529 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD46P15529 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD46P15529 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD46P15529 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD46P15529 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD46P15529 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD46P15529 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD46P15529 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD46P15529 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD46P15529 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD46P15529 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD46P15529 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD46P15529 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD46P15529 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD46P15529 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD46P15529 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD46P15529 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD46P15529 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD46P15529 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD46P15529 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD46P15529 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD46P15529 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD46P15529 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD46P15529 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD46P15529 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD46P15529 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD46P15529 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD46P15529 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD46P15529 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD46P15529 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CD46P15529 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD46P15529 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CD46P15529 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD46P15529 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD46P15529 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD46P15529 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD46P15529 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD46P15529 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD46P15529 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD46P15529 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD46P15529 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD46P15529 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD46P15529 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD46P15529 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD46P15529 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD46P15529 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD46P15529 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD46P15529 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD46P15529 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD46P15529 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD46P15529 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD46P15529 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD46P15529 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD46P15529 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD46P15529 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD46P15529 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD46P15529 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD46P15529 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD46P15529 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD46P15529 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD46P15529 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD46P15529 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD46P15529 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD46P15529 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD46P15529 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD46P15529 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD46P15529 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD46P15529 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD46P15529 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD46P15529 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD46P15529 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD46P15529 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD46P15529 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD46P15529 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms