Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCSHP14314 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCSHP14314 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRKCSHP14314 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRKCSHP14314 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCSHP14314 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms