Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ETFAP13804 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ETFAP13804 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETFAP13804 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETFAP13804 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETFAP13804 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETFAP13804 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETFAP13804 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETFAP13804 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETFAP13804 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ETFAP13804 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ETFAP13804 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ETFAP13804 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ETFAP13804 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ETFAP13804 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETFAP13804 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETFAP13804 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETFAP13804 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETFAP13804 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETFAP13804 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETFAP13804 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ETFAP13804 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ETFAP13804 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ETFAP13804 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETFAP13804 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETFAP13804 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETFAP13804 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETFAP13804 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETFAP13804 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETFAP13804 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETFAP13804 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETFAP13804 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETFAP13804 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETFAP13804 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFAP13804 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFAP13804 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFAP13804 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFAP13804 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFAP13804 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFAP13804 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFAP13804 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFAP13804 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFAP13804 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFAP13804 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFAP13804 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFAP13804 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFAP13804 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFAP13804 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFAP13804 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFAP13804 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFAP13804 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFAP13804 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ETFAP13804 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETFAP13804 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETFAP13804 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETFAP13804 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETFAP13804 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETFAP13804 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETFAP13804 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ETFAP13804 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ETFAP13804 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETFAP13804 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETFAP13804 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETFAP13804 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETFAP13804 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFAP13804 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFAP13804 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFAP13804 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFAP13804 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETFAP13804 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETFAP13804 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETFAP13804 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETFAP13804 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETFAP13804 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETFAP13804 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETFAP13804 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETFAP13804 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETFAP13804 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETFAP13804 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETFAP13804 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ETFAP13804 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETFAP13804 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETFAP13804 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETFAP13804 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETFAP13804 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETFAP13804 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETFAP13804 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETFAP13804 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ETFAP13804 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ETFAP13804 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ETFAP13804 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ETFAP13804 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ETFAP13804 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ETFAP13804 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ETFAP13804 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ETFAP13804 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ETFAP13804 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ETFAP13804 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ETFAP13804 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ETFAP13804 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms