Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM1P13688 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM1P13688 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEACAM1P13688 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEACAM1P13688 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms