Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR2C1P13056 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2C1P13056 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR2C1P13056 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C1P13056 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2C1P13056 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C1P13056 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C1P13056 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C1P13056 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C1P13056 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C1P13056 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2C1P13056 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2C1P13056 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2C1P13056 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2C1P13056 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C1P13056 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2C1P13056 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms