Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HARSP12081 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARSP12081 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARSP12081 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARSP12081 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARSP12081 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARSP12081 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARSP12081 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARSP12081 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARSP12081 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARSP12081 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARSP12081 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARSP12081 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARSP12081 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARSP12081 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HARSP12081 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HARSP12081 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HARSP12081 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HARSP12081 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HARSP12081 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HARSP12081 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HARSP12081 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HARSP12081 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HARSP12081 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HARSP12081 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HARSP12081 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HARSP12081 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HARSP12081 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HARSP12081 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HARSP12081 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HARSP12081 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HARSP12081 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HARSP12081 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HARSP12081 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HARSP12081 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HARSP12081 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HARSP12081 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HARSP12081 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HARSP12081 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HARSP12081 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HARSP12081 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HARSP12081 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HARSP12081 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HARSP12081 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HARSP12081 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HARSP12081 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HARSP12081 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HARSP12081 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HARSP12081 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HARSP12081 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HARSP12081 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HARSP12081 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HARSP12081 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HARSP12081 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HARSP12081 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HARSP12081 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HARSP12081 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HARSP12081 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HARSP12081 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HARSP12081 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HARSP12081 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HARSP12081 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HARSP12081 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HARSP12081 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HARSP12081 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HARSP12081 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HARSP12081 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HARSP12081 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HARSP12081 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HARSP12081 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HARSP12081 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HARSP12081 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HARSP12081 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HARSP12081 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HARSP12081 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HARSP12081 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HARSP12081 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HARSP12081 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HARSP12081 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HARSP12081 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HARSP12081 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HARSP12081 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HARSP12081 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HARSP12081 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HARSP12081 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HARSP12081 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HARSP12081 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HARSP12081 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HARSP12081 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HARSP12081 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HARSP12081 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HARSP12081 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HARSP12081 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HARSP12081 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HARSP12081 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HARSP12081 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HARSP12081 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HARSP12081 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HARSP12081 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HARSP12081 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.8 ms