Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
MS4A1P11836 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MS4A1P11836 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MS4A1P11836 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MS4A1P11836 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
MS4A1P11836 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms