Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRFP11831 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRFP11831 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRFP11831 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRFP11831 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRFP11831 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRFP11831 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRFP11831 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRFP11831 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRFP11831 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRFP11831 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRFP11831 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRFP11831 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRFP11831 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRFP11831 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRFP11831 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRFP11831 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRFP11831 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRFP11831 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRFP11831 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SRFP11831 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRFP11831 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRFP11831 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRFP11831 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRFP11831 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRFP11831 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRFP11831 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRFP11831 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRFP11831 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRFP11831 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SRFP11831 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRFP11831 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRFP11831 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRFP11831 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRFP11831 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRFP11831 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRFP11831 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRFP11831 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRFP11831 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRFP11831 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRFP11831 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRFP11831 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRFP11831 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRFP11831 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRFP11831 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRFP11831 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRFP11831 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRFP11831 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SRFP11831 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRFP11831 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRFP11831 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SRFP11831 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRFP11831 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRFP11831 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRFP11831 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRFP11831 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRFP11831 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRFP11831 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRFP11831 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRFP11831 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRFP11831 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRFP11831 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRFP11831 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRFP11831 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRFP11831 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRFP11831 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRFP11831 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRFP11831 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRFP11831 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SRFP11831 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SRFP11831 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SRFP11831 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRFP11831 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRFP11831 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRFP11831 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRFP11831 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRFP11831 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRFP11831 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRFP11831 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRFP11831 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SRFP11831 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRFP11831 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SRFP11831 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SRFP11831 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRFP11831 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRFP11831 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRFP11831 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SRFP11831 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRFP11831 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRFP11831 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRFP11831 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRFP11831 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRFP11831 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRFP11831 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRFP11831 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SRFP11831 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRFP11831 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRFP11831 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRFP11831 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SRFP11831 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms