Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ESRRAP11474 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ESRRAP11474 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ESRRAP11474 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms