Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF1P10914 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF1P10914 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRF1P10914 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
IRF1P10914 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRF1P10914 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRF1P10914 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRF1P10914 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF1P10914 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF1P10914 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF1P10914 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF1P10914 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF1P10914 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF1P10914 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF1P10914 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF1P10914 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF1P10914 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IRF1P10914 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
IRF1P10914 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
IRF1P10914 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRF1P10914 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRF1P10914 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF1P10914 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF1P10914 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF1P10914 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF1P10914 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
IRF1P10914 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF1P10914 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF1P10914 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRF1P10914 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF1P10914 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF1P10914 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF1P10914 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF1P10914 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRF1P10914 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF1P10914 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF1P10914 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF1P10914 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF1P10914 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF1P10914 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF1P10914 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF1P10914 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRF1P10914 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRF1P10914 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRF1P10914 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF1P10914 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF1P10914 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF1P10914 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF1P10914 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF1P10914 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF1P10914 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF1P10914 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF1P10914 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF1P10914 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF1P10914 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF1P10914 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF1P10914 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF1P10914 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF1P10914 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF1P10914 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF1P10914 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF1P10914 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF1P10914 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF1P10914 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF1P10914 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF1P10914 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF1P10914 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF1P10914 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF1P10914 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF1P10914 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF1P10914 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF1P10914 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF1P10914 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF1P10914 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF1P10914 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
IRF1P10914 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF1P10914 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF1P10914 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF1P10914 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF1P10914 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF1P10914 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF1P10914 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF1P10914 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF1P10914 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF1P10914 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF1P10914 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF1P10914 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF1P10914 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF1P10914 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF1P10914 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF1P10914 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF1P10914 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF1P10914 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF1P10914 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF1P10914 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF1P10914 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF1P10914 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF1P10914 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRF1P10914 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRF1P10914 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms