Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM225BP0DP42 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM225BP0DP42 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms