Protein–RNA interactions for Protein: P0CL83

STAG3L1, Putative STAG3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L1P0CL83 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
STAG3L1P0CL83 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG3L1P0CL83 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3L1P0CL83 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.57■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.54■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.54■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG3L1P0CL83 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG3L1P0CL83 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STAG3L1P0CL83 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STAG3L1P0CL83 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG3L1P0CL83 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms