Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC4P0CG21 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NHLRC4P0CG21 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHLRC4P0CG21 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms