Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSL3P1P0C860 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSL3P1P0C860 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSL3P1P0C860 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSL3P1P0C860 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms