Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FREM3P0C091 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FREM3P0C091 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FREM3P0C091 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms