Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPSAP08865 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPSAP08865 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPSAP08865 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPSAP08865 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPSAP08865 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPSAP08865 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPSAP08865 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPSAP08865 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPSAP08865 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPSAP08865 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPSAP08865 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPSAP08865 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPSAP08865 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPSAP08865 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPSAP08865 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPSAP08865 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPSAP08865 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPSAP08865 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPSAP08865 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPSAP08865 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPSAP08865 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPSAP08865 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPSAP08865 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPSAP08865 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPSAP08865 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPSAP08865 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPSAP08865 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPSAP08865 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPSAP08865 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPSAP08865 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPSAP08865 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPSAP08865 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPSAP08865 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPSAP08865 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPSAP08865 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPSAP08865 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPSAP08865 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPSAP08865 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPSAP08865 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPSAP08865 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPSAP08865 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPSAP08865 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPSAP08865 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPSAP08865 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPSAP08865 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPSAP08865 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPSAP08865 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPSAP08865 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPSAP08865 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPSAP08865 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPSAP08865 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPSAP08865 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPSAP08865 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPSAP08865 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPSAP08865 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPSAP08865 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPSAP08865 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPSAP08865 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPSAP08865 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPSAP08865 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPSAP08865 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPSAP08865 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPSAP08865 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPSAP08865 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPSAP08865 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPSAP08865 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPSAP08865 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPSAP08865 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPSAP08865 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPSAP08865 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPSAP08865 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPSAP08865 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPSAP08865 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPSAP08865 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPSAP08865 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPSAP08865 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPSAP08865 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPSAP08865 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPSAP08865 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPSAP08865 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPSAP08865 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPSAP08865 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPSAP08865 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPSAP08865 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPSAP08865 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPSAP08865 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPSAP08865 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPSAP08865 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPSAP08865 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPSAP08865 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPSAP08865 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPSAP08865 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPSAP08865 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPSAP08865 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPSAP08865 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPSAP08865 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPSAP08865 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPSAP08865 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPSAP08865 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms