Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMBSP08397 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMBSP08397 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMBSP08397 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMBSP08397 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HMBSP08397 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMBSP08397 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMBSP08397 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMBSP08397 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMBSP08397 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMBSP08397 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMBSP08397 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMBSP08397 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMBSP08397 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HMBSP08397 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMBSP08397 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMBSP08397 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HMBSP08397 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMBSP08397 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMBSP08397 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMBSP08397 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMBSP08397 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMBSP08397 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMBSP08397 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMBSP08397 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMBSP08397 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMBSP08397 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMBSP08397 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMBSP08397 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMBSP08397 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMBSP08397 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMBSP08397 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMBSP08397 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMBSP08397 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMBSP08397 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HMBSP08397 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMBSP08397 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HMBSP08397 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMBSP08397 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HMBSP08397 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HMBSP08397 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMBSP08397 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMBSP08397 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMBSP08397 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMBSP08397 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMBSP08397 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMBSP08397 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMBSP08397 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMBSP08397 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMBSP08397 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HMBSP08397 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMBSP08397 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMBSP08397 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMBSP08397 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMBSP08397 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMBSP08397 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMBSP08397 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMBSP08397 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMBSP08397 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMBSP08397 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMBSP08397 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMBSP08397 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMBSP08397 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMBSP08397 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMBSP08397 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMBSP08397 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMBSP08397 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMBSP08397 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMBSP08397 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HMBSP08397 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HMBSP08397 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMBSP08397 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HMBSP08397 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMBSP08397 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMBSP08397 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMBSP08397 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMBSP08397 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMBSP08397 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMBSP08397 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMBSP08397 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMBSP08397 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMBSP08397 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMBSP08397 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMBSP08397 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMBSP08397 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMBSP08397 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMBSP08397 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMBSP08397 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMBSP08397 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMBSP08397 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMBSP08397 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMBSP08397 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMBSP08397 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMBSP08397 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMBSP08397 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMBSP08397 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMBSP08397 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMBSP08397 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMBSP08397 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMBSP08397 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms