Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSBP07858 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSBP07858 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSBP07858 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSBP07858 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSBP07858 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSBP07858 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSBP07858 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSBP07858 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSBP07858 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSBP07858 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSBP07858 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSBP07858 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSBP07858 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSBP07858 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSBP07858 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSBP07858 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSBP07858 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSBP07858 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSBP07858 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTSBP07858 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTSBP07858 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSBP07858 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSBP07858 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSBP07858 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSBP07858 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSBP07858 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSBP07858 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSBP07858 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSBP07858 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSBP07858 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSBP07858 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSBP07858 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSBP07858 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSBP07858 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSBP07858 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSBP07858 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSBP07858 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSBP07858 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSBP07858 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSBP07858 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSBP07858 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSBP07858 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSBP07858 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSBP07858 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSBP07858 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSBP07858 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSBP07858 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSBP07858 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSBP07858 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSBP07858 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSBP07858 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSBP07858 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSBP07858 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSBP07858 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSBP07858 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTSBP07858 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSBP07858 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSBP07858 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSBP07858 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSBP07858 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSBP07858 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSBP07858 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSBP07858 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSBP07858 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSBP07858 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSBP07858 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSBP07858 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSBP07858 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSBP07858 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSBP07858 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSBP07858 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSBP07858 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSBP07858 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSBP07858 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSBP07858 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSBP07858 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSBP07858 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSBP07858 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSBP07858 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSBP07858 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSBP07858 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSBP07858 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSBP07858 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSBP07858 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSBP07858 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSBP07858 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSBP07858 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSBP07858 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSBP07858 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSBP07858 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSBP07858 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSBP07858 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSBP07858 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSBP07858 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSBP07858 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSBP07858 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSBP07858 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSBP07858 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSBP07858 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms