Protein–RNA interactions for Protein: P05204

HMGN2, Non-histone chromosomal protein HMG-17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P05204 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGN2P05204 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGN2P05204 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms