Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCBP05166 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCBP05166 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCBP05166 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCBP05166 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCBP05166 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCBP05166 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCBP05166 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCBP05166 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCBP05166 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCBP05166 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCBP05166 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCBP05166 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCBP05166 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCBP05166 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCBP05166 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCBP05166 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCBP05166 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCBP05166 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCBP05166 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCBP05166 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCBP05166 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCBP05166 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCBP05166 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCBP05166 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCBP05166 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCBP05166 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCBP05166 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCBP05166 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCBP05166 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCCBP05166 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCCBP05166 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCCBP05166 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCCBP05166 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCCBP05166 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCCBP05166 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCCBP05166 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCCBP05166 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCCBP05166 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCCBP05166 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCCBP05166 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCCBP05166 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PCCBP05166 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCCBP05166 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCCBP05166 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCCBP05166 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PCCBP05166 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCCBP05166 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCCBP05166 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCCBP05166 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCCBP05166 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCCBP05166 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCCBP05166 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCCBP05166 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCCBP05166 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCCBP05166 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCBP05166 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCBP05166 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCCBP05166 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCBP05166 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCBP05166 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCBP05166 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCCBP05166 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCCBP05166 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCBP05166 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCBP05166 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCBP05166 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCCBP05166 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCBP05166 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCBP05166 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCBP05166 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCBP05166 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCCBP05166 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCBP05166 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCBP05166 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCBP05166 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCBP05166 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCCBP05166 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCBP05166 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCBP05166 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCBP05166 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCCBP05166 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCCBP05166 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCCBP05166 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCCBP05166 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCCBP05166 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCCBP05166 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCCBP05166 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCCBP05166 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCCBP05166 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCCBP05166 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCCBP05166 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCCBP05166 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCCBP05166 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCCBP05166 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCCBP05166 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCCBP05166 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCCBP05166 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCCBP05166 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCCBP05166 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms