Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1B1P05026 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1B1P05026 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1B1P05026 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1B1P05026 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1B1P05026 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms