Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNW1P05000 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNW1P05000 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNW1P05000 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNW1P05000 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms