Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYCNP04198 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYCNP04198 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYCNP04198 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYCNP04198 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MYCNP04198 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYCNP04198 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYCNP04198 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYCNP04198 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYCNP04198 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYCNP04198 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYCNP04198 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYCNP04198 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYCNP04198 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYCNP04198 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYCNP04198 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYCNP04198 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYCNP04198 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYCNP04198 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYCNP04198 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYCNP04198 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYCNP04198 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYCNP04198 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYCNP04198 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYCNP04198 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYCNP04198 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYCNP04198 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MYCNP04198 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYCNP04198 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MYCNP04198 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYCNP04198 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYCNP04198 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MYCNP04198 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MYCNP04198 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYCNP04198 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYCNP04198 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYCNP04198 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYCNP04198 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYCNP04198 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYCNP04198 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYCNP04198 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYCNP04198 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYCNP04198 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYCNP04198 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MYCNP04198 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYCNP04198 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYCNP04198 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYCNP04198 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYCNP04198 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYCNP04198 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYCNP04198 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYCNP04198 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYCNP04198 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MYCNP04198 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MYCNP04198 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYCNP04198 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYCNP04198 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYCNP04198 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYCNP04198 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYCNP04198 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYCNP04198 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYCNP04198 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYCNP04198 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYCNP04198 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYCNP04198 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYCNP04198 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYCNP04198 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYCNP04198 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYCNP04198 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYCNP04198 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYCNP04198 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MYCNP04198 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYCNP04198 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYCNP04198 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYCNP04198 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYCNP04198 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYCNP04198 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYCNP04198 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYCNP04198 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MYCNP04198 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYCNP04198 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYCNP04198 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYCNP04198 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYCNP04198 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYCNP04198 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYCNP04198 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYCNP04198 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYCNP04198 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYCNP04198 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYCNP04198 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYCNP04198 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MYCNP04198 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYCNP04198 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYCNP04198 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYCNP04198 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYCNP04198 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYCNP04198 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MYCNP04198 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYCNP04198 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYCNP04198 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms