Protein–RNA interactions for Protein: P02538

KRT6A, Keratin, type II cytoskeletal 6A, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6AP02538 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT6AP02538 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT6AP02538 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT6AP02538 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT6AP02538 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT6AP02538 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT6AP02538 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT6AP02538 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT6AP02538 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT6AP02538 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT6AP02538 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT6AP02538 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT6AP02538 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT6AP02538 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT6AP02538 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT6AP02538 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT6AP02538 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT6AP02538 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT6AP02538 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT6AP02538 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT6AP02538 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms