Protein–RNA interactions for Protein: P01732

CD8A, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8AP01732 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8AP01732 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8AP01732 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8AP01732 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8AP01732 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8AP01732 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8AP01732 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8AP01732 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8AP01732 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD8AP01732 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD8AP01732 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD8AP01732 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD8AP01732 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD8AP01732 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8AP01732 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8AP01732 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8AP01732 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8AP01732 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8AP01732 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8AP01732 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8AP01732 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8AP01732 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8AP01732 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8AP01732 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8AP01732 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8AP01732 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8AP01732 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8AP01732 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8AP01732 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8AP01732 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8AP01732 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8AP01732 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD8AP01732 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD8AP01732 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD8AP01732 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD8AP01732 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8AP01732 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8AP01732 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8AP01732 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8AP01732 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8AP01732 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8AP01732 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8AP01732 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8AP01732 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8AP01732 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD8AP01732 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD8AP01732 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD8AP01732 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD8AP01732 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8AP01732 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8AP01732 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8AP01732 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8AP01732 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8AP01732 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8AP01732 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8AP01732 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8AP01732 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8AP01732 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8AP01732 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8AP01732 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8AP01732 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8AP01732 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8AP01732 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8AP01732 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD8AP01732 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD8AP01732 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8AP01732 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8AP01732 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8AP01732 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8AP01732 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8AP01732 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8AP01732 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8AP01732 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8AP01732 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8AP01732 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8AP01732 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8AP01732 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8AP01732 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8AP01732 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8AP01732 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8AP01732 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8AP01732 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8AP01732 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8AP01732 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8AP01732 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8AP01732 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8AP01732 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8AP01732 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8AP01732 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8AP01732 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8AP01732 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD8AP01732 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD8AP01732 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD8AP01732 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8AP01732 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8AP01732 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8AP01732 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8AP01732 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8AP01732 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8AP01732 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms