Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
F13A1P00488 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
F13A1P00488 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
F13A1P00488 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
F13A1P00488 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
F13A1P00488 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
F13A1P00488 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
F13A1P00488 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
F13A1P00488 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
F13A1P00488 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
F13A1P00488 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
F13A1P00488 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
F13A1P00488 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
F13A1P00488 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
F13A1P00488 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
F13A1P00488 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
F13A1P00488 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
F13A1P00488 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
F13A1P00488 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
F13A1P00488 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
F13A1P00488 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
F13A1P00488 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
F13A1P00488 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
F13A1P00488 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
F13A1P00488 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
F13A1P00488 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
F13A1P00488 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
F13A1P00488 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
F13A1P00488 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
F13A1P00488 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
F13A1P00488 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
F13A1P00488 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
F13A1P00488 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
F13A1P00488 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
F13A1P00488 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
F13A1P00488 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
F13A1P00488 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
F13A1P00488 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
F13A1P00488 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
F13A1P00488 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
F13A1P00488 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
F13A1P00488 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
F13A1P00488 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
F13A1P00488 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
F13A1P00488 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
F13A1P00488 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
F13A1P00488 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
F13A1P00488 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
F13A1P00488 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
F13A1P00488 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
F13A1P00488 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
F13A1P00488 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
F13A1P00488 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
F13A1P00488 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
F13A1P00488 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
F13A1P00488 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
F13A1P00488 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
F13A1P00488 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
F13A1P00488 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
F13A1P00488 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
F13A1P00488 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
F13A1P00488 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
F13A1P00488 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
F13A1P00488 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
F13A1P00488 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
F13A1P00488 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
F13A1P00488 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
F13A1P00488 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
F13A1P00488 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
F13A1P00488 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
F13A1P00488 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
F13A1P00488 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
F13A1P00488 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
F13A1P00488 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
F13A1P00488 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
F13A1P00488 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
F13A1P00488 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
F13A1P00488 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
F13A1P00488 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
F13A1P00488 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
F13A1P00488 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
F13A1P00488 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
F13A1P00488 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
F13A1P00488 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
F13A1P00488 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
F13A1P00488 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
F13A1P00488 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
F13A1P00488 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
F13A1P00488 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
F13A1P00488 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
F13A1P00488 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
F13A1P00488 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
F13A1P00488 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
F13A1P00488 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
F13A1P00488 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
F13A1P00488 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
F13A1P00488 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
F13A1P00488 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
F13A1P00488 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
F13A1P00488 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms