Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX7O95931 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX7O95931 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX7O95931 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX7O95931 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX7O95931 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX7O95931 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX7O95931 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX7O95931 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX7O95931 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX7O95931 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX7O95931 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX7O95931 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX7O95931 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX7O95931 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX7O95931 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX7O95931 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX7O95931 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX7O95931 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX7O95931 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX7O95931 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX7O95931 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX7O95931 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX7O95931 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX7O95931 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX7O95931 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX7O95931 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX7O95931 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX7O95931 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX7O95931 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX7O95931 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBX7O95931 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX7O95931 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX7O95931 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX7O95931 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX7O95931 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX7O95931 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX7O95931 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX7O95931 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX7O95931 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX7O95931 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX7O95931 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX7O95931 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX7O95931 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX7O95931 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX7O95931 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX7O95931 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX7O95931 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX7O95931 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX7O95931 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX7O95931 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX7O95931 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX7O95931 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX7O95931 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX7O95931 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX7O95931 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX7O95931 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX7O95931 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX7O95931 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX7O95931 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX7O95931 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX7O95931 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX7O95931 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX7O95931 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX7O95931 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX7O95931 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX7O95931 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX7O95931 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX7O95931 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX7O95931 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX7O95931 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX7O95931 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX7O95931 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX7O95931 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX7O95931 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX7O95931 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX7O95931 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX7O95931 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX7O95931 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX7O95931 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX7O95931 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX7O95931 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX7O95931 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CBX7O95931 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX7O95931 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX7O95931 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX7O95931 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX7O95931 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX7O95931 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX7O95931 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX7O95931 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX7O95931 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX7O95931 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX7O95931 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX7O95931 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX7O95931 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX7O95931 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX7O95931 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX7O95931 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX7O95931 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms