Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24AO95486 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SEC24AO95486 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEC24AO95486 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24AO95486 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms