Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAPBO95292 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAPBO95292 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAPBO95292 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VAPBO95292 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAPBO95292 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAPBO95292 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAPBO95292 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAPBO95292 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAPBO95292 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAPBO95292 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAPBO95292 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAPBO95292 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAPBO95292 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAPBO95292 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAPBO95292 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAPBO95292 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAPBO95292 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAPBO95292 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAPBO95292 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAPBO95292 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAPBO95292 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAPBO95292 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAPBO95292 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAPBO95292 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAPBO95292 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAPBO95292 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAPBO95292 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAPBO95292 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAPBO95292 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAPBO95292 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAPBO95292 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAPBO95292 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAPBO95292 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAPBO95292 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAPBO95292 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAPBO95292 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAPBO95292 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAPBO95292 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAPBO95292 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAPBO95292 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAPBO95292 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAPBO95292 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAPBO95292 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAPBO95292 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAPBO95292 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAPBO95292 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAPBO95292 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAPBO95292 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAPBO95292 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAPBO95292 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAPBO95292 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAPBO95292 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAPBO95292 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAPBO95292 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAPBO95292 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAPBO95292 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAPBO95292 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAPBO95292 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAPBO95292 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAPBO95292 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAPBO95292 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAPBO95292 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAPBO95292 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAPBO95292 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAPBO95292 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAPBO95292 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAPBO95292 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAPBO95292 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAPBO95292 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAPBO95292 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAPBO95292 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAPBO95292 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAPBO95292 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAPBO95292 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VAPBO95292 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAPBO95292 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAPBO95292 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAPBO95292 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VAPBO95292 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAPBO95292 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAPBO95292 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAPBO95292 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAPBO95292 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAPBO95292 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAPBO95292 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAPBO95292 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAPBO95292 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAPBO95292 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAPBO95292 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAPBO95292 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAPBO95292 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAPBO95292 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAPBO95292 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAPBO95292 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAPBO95292 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAPBO95292 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAPBO95292 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAPBO95292 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAPBO95292 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms