Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RHOBTB3O94955 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RHOBTB3O94955 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RHOBTB3O94955 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RHOBTB3O94955 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RHOBTB3O94955 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RHOBTB3O94955 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms