Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RHOBTB3O94955 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RHOBTB3O94955 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RHOBTB3O94955 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHOBTB3O94955 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHOBTB3O94955 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RHOBTB3O94955 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RHOBTB3O94955 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RHOBTB3O94955 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RHOBTB3O94955 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RHOBTB3O94955 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms