Protein–RNA interactions for Protein: O75596

CLEC3A, C-type lectin domain family 3 member A, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3AO75596 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC3AO75596 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC3AO75596 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC3AO75596 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC3AO75596 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC3AO75596 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC3AO75596 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC3AO75596 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC3AO75596 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC3AO75596 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC3AO75596 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC3AO75596 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC3AO75596 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC3AO75596 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLEC3AO75596 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLEC3AO75596 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLEC3AO75596 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms