Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRCPO75575 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRCPO75575 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRCPO75575 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRCPO75575 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRCPO75575 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRCPO75575 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRCPO75575 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CRCPO75575 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRCPO75575 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRCPO75575 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRCPO75575 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRCPO75575 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRCPO75575 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRCPO75575 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRCPO75575 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRCPO75575 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRCPO75575 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRCPO75575 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRCPO75575 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRCPO75575 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRCPO75575 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRCPO75575 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRCPO75575 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CRCPO75575 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRCPO75575 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRCPO75575 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRCPO75575 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRCPO75575 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRCPO75575 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRCPO75575 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRCPO75575 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRCPO75575 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRCPO75575 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRCPO75575 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRCPO75575 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRCPO75575 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRCPO75575 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRCPO75575 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRCPO75575 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRCPO75575 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRCPO75575 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRCPO75575 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRCPO75575 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRCPO75575 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CRCPO75575 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRCPO75575 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRCPO75575 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRCPO75575 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRCPO75575 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRCPO75575 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRCPO75575 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRCPO75575 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRCPO75575 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRCPO75575 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRCPO75575 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRCPO75575 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRCPO75575 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRCPO75575 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRCPO75575 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRCPO75575 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRCPO75575 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRCPO75575 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRCPO75575 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRCPO75575 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRCPO75575 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRCPO75575 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRCPO75575 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRCPO75575 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRCPO75575 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRCPO75575 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRCPO75575 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRCPO75575 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRCPO75575 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRCPO75575 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRCPO75575 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRCPO75575 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRCPO75575 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRCPO75575 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRCPO75575 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRCPO75575 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRCPO75575 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRCPO75575 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRCPO75575 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRCPO75575 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRCPO75575 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRCPO75575 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRCPO75575 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRCPO75575 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRCPO75575 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRCPO75575 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRCPO75575 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRCPO75575 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRCPO75575 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRCPO75575 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRCPO75575 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRCPO75575 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRCPO75575 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRCPO75575 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRCPO75575 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms