Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH16O75452 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH16O75452 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDH16O75452 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDH16O75452 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDH16O75452 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDH16O75452 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH16O75452 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH16O75452 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH16O75452 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RDH16O75452 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RDH16O75452 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RDH16O75452 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RDH16O75452 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RDH16O75452 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RDH16O75452 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RDH16O75452 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RDH16O75452 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RDH16O75452 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RDH16O75452 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RDH16O75452 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RDH16O75452 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RDH16O75452 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RDH16O75452 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RDH16O75452 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RDH16O75452 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RDH16O75452 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RDH16O75452 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RDH16O75452 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RDH16O75452 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RDH16O75452 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RDH16O75452 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RDH16O75452 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RDH16O75452 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RDH16O75452 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RDH16O75452 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RDH16O75452 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RDH16O75452 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RDH16O75452 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RDH16O75452 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RDH16O75452 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RDH16O75452 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RDH16O75452 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RDH16O75452 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RDH16O75452 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RDH16O75452 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RDH16O75452 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RDH16O75452 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RDH16O75452 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RDH16O75452 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RDH16O75452 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RDH16O75452 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RDH16O75452 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RDH16O75452 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RDH16O75452 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDH16O75452 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDH16O75452 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDH16O75452 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDH16O75452 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDH16O75452 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDH16O75452 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDH16O75452 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDH16O75452 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDH16O75452 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDH16O75452 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH16O75452 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH16O75452 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH16O75452 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH16O75452 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH16O75452 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH16O75452 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDH16O75452 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDH16O75452 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDH16O75452 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDH16O75452 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDH16O75452 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDH16O75452 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH16O75452 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH16O75452 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH16O75452 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH16O75452 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH16O75452 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH16O75452 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH16O75452 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH16O75452 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH16O75452 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDH16O75452 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDH16O75452 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDH16O75452 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDH16O75452 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDH16O75452 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDH16O75452 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDH16O75452 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDH16O75452 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDH16O75452 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDH16O75452 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDH16O75452 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDH16O75452 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDH16O75452 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDH16O75452 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms