Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIA4O75335 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIA4O75335 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPFIA4O75335 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA4O75335 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms