Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRAMEF10O60809 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF10O60809 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF10O60809 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms