Protein–RNA interactions for Protein: O60765

ZNF354A, Zinc finger protein 354A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354AO60765 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354AO60765 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF354AO60765 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF354AO60765 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF354AO60765 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF354AO60765 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF354AO60765 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF354AO60765 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF354AO60765 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF354AO60765 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF354AO60765 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF354AO60765 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF354AO60765 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF354AO60765 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF354AO60765 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF354AO60765 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF354AO60765 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms