Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLIN3O60664 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLIN3O60664 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLIN3O60664 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN3O60664 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms