Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GFRA3O60609 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GFRA3O60609 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRA3O60609 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms