Protein–RNA interactions for Protein: O60315

ZEB2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB2O60315 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZEB2O60315 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZEB2O60315 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZEB2O60315 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms