Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
KIAA0556O60303 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
KIAA0556O60303 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
KIAA0556O60303 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
KIAA0556O60303 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC40.69■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC40.67■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC40.64■■■■■ 4.1
KIAA0556O60303 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
KIAA0556O60303 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.54■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
KIAA0556O60303 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
KIAA0556O60303 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
KIAA0556O60303 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
KIAA0556O60303 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
KIAA0556O60303 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
KIAA0556O60303 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
KIAA0556O60303 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
KIAA0556O60303 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
KIAA0556O60303 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
KIAA0556O60303 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.06
KIAA0556O60303 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC40.38■■■■■ 4.06
KIAA0556O60303 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
KIAA0556O60303 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
KIAA0556O60303 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms