Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCXO43602 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCXO43602 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCXO43602 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCXO43602 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCXO43602 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DCXO43602 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCXO43602 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCXO43602 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCXO43602 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCXO43602 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCXO43602 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCXO43602 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCXO43602 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCXO43602 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCXO43602 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCXO43602 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCXO43602 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCXO43602 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCXO43602 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCXO43602 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCXO43602 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCXO43602 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCXO43602 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCXO43602 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCXO43602 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DCXO43602 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCXO43602 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCXO43602 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCXO43602 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCXO43602 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCXO43602 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCXO43602 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCXO43602 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCXO43602 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCXO43602 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DCXO43602 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCXO43602 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCXO43602 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCXO43602 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCXO43602 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCXO43602 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DCXO43602 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCXO43602 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCXO43602 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DCXO43602 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCXO43602 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCXO43602 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCXO43602 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCXO43602 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DCXO43602 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCXO43602 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCXO43602 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCXO43602 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCXO43602 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCXO43602 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCXO43602 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCXO43602 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCXO43602 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCXO43602 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DCXO43602 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCXO43602 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCXO43602 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCXO43602 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DCXO43602 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCXO43602 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DCXO43602 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCXO43602 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCXO43602 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DCXO43602 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCXO43602 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCXO43602 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCXO43602 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DCXO43602 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCXO43602 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DCXO43602 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCXO43602 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCXO43602 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DCXO43602 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCXO43602 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCXO43602 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCXO43602 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCXO43602 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCXO43602 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCXO43602 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DCXO43602 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCXO43602 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCXO43602 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DCXO43602 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCXO43602 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCXO43602 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCXO43602 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCXO43602 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCXO43602 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCXO43602 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCXO43602 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCXO43602 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCXO43602 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCXO43602 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCXO43602 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms