Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT7O43581 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT7O43581 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT7O43581 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT7O43581 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT7O43581 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT7O43581 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT7O43581 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT7O43581 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT7O43581 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT7O43581 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT7O43581 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT7O43581 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT7O43581 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT7O43581 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT7O43581 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT7O43581 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT7O43581 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT7O43581 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT7O43581 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT7O43581 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT7O43581 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT7O43581 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT7O43581 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT7O43581 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT7O43581 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT7O43581 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT7O43581 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT7O43581 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT7O43581 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT7O43581 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT7O43581 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT7O43581 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT7O43581 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT7O43581 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT7O43581 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT7O43581 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYT7O43581 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYT7O43581 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT7O43581 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT7O43581 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT7O43581 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT7O43581 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT7O43581 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT7O43581 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT7O43581 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT7O43581 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT7O43581 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT7O43581 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT7O43581 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT7O43581 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT7O43581 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT7O43581 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT7O43581 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT7O43581 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT7O43581 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYT7O43581 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYT7O43581 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYT7O43581 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT7O43581 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT7O43581 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT7O43581 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT7O43581 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT7O43581 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT7O43581 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT7O43581 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT7O43581 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT7O43581 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT7O43581 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT7O43581 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT7O43581 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT7O43581 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT7O43581 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT7O43581 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT7O43581 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT7O43581 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT7O43581 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT7O43581 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT7O43581 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT7O43581 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT7O43581 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT7O43581 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT7O43581 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT7O43581 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT7O43581 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT7O43581 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT7O43581 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT7O43581 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT7O43581 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT7O43581 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYT7O43581 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYT7O43581 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT7O43581 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT7O43581 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT7O43581 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT7O43581 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT7O43581 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT7O43581 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT7O43581 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT7O43581 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms