Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF4O43474 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF4O43474 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF4O43474 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF4O43474 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF4O43474 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF4O43474 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF4O43474 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF4O43474 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF4O43474 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF4O43474 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLF4O43474 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLF4O43474 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KLF4O43474 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLF4O43474 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF4O43474 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF4O43474 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF4O43474 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF4O43474 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF4O43474 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF4O43474 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF4O43474 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF4O43474 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF4O43474 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF4O43474 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF4O43474 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF4O43474 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF4O43474 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF4O43474 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF4O43474 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF4O43474 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF4O43474 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF4O43474 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF4O43474 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF4O43474 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF4O43474 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF4O43474 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF4O43474 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF4O43474 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF4O43474 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF4O43474 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF4O43474 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF4O43474 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF4O43474 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF4O43474 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF4O43474 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF4O43474 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF4O43474 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF4O43474 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF4O43474 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF4O43474 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF4O43474 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF4O43474 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF4O43474 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF4O43474 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLF4O43474 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLF4O43474 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLF4O43474 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF4O43474 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF4O43474 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF4O43474 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF4O43474 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF4O43474 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF4O43474 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF4O43474 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF4O43474 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF4O43474 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF4O43474 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF4O43474 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF4O43474 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF4O43474 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF4O43474 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF4O43474 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF4O43474 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF4O43474 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF4O43474 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF4O43474 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF4O43474 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF4O43474 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF4O43474 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF4O43474 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF4O43474 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF4O43474 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF4O43474 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF4O43474 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF4O43474 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF4O43474 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF4O43474 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF4O43474 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF4O43474 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF4O43474 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF4O43474 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF4O43474 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF4O43474 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF4O43474 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLF4O43474 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLF4O43474 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLF4O43474 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF4O43474 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF4O43474 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.5 ms