Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEFVO15553 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEFVO15553 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEFVO15553 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEFVO15553 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEFVO15553 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEFVO15553 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEFVO15553 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEFVO15553 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEFVO15553 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEFVO15553 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEFVO15553 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEFVO15553 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEFVO15553 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEFVO15553 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEFVO15553 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEFVO15553 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEFVO15553 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEFVO15553 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEFVO15553 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEFVO15553 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEFVO15553 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEFVO15553 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEFVO15553 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MEFVO15553 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEFVO15553 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEFVO15553 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEFVO15553 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEFVO15553 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEFVO15553 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEFVO15553 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEFVO15553 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEFVO15553 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEFVO15553 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEFVO15553 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MEFVO15553 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MEFVO15553 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MEFVO15553 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MEFVO15553 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEFVO15553 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MEFVO15553 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEFVO15553 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MEFVO15553 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEFVO15553 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEFVO15553 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEFVO15553 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEFVO15553 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEFVO15553 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MEFVO15553 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MEFVO15553 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MEFVO15553 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEFVO15553 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEFVO15553 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEFVO15553 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEFVO15553 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MEFVO15553 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEFVO15553 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEFVO15553 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEFVO15553 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEFVO15553 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEFVO15553 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEFVO15553 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEFVO15553 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEFVO15553 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEFVO15553 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEFVO15553 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MEFVO15553 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEFVO15553 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEFVO15553 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEFVO15553 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEFVO15553 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEFVO15553 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEFVO15553 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEFVO15553 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEFVO15553 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEFVO15553 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEFVO15553 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEFVO15553 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEFVO15553 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEFVO15553 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEFVO15553 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEFVO15553 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEFVO15553 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEFVO15553 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEFVO15553 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEFVO15553 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEFVO15553 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEFVO15553 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEFVO15553 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEFVO15553 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEFVO15553 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEFVO15553 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEFVO15553 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEFVO15553 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEFVO15553 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEFVO15553 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEFVO15553 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEFVO15553 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEFVO15553 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MEFVO15553 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms