Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SOCS1O15524 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOCS1O15524 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOCS1O15524 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS1O15524 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS1O15524 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SOCS1O15524 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS1O15524 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS1O15524 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SOCS1O15524 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS1O15524 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SOCS1O15524 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOCS1O15524 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOCS1O15524 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOCS1O15524 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS1O15524 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS1O15524 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS1O15524 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS1O15524 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS1O15524 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS1O15524 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOCS1O15524 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS1O15524 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS1O15524 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS1O15524 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS1O15524 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS1O15524 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOCS1O15524 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOCS1O15524 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SOCS1O15524 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOCS1O15524 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOCS1O15524 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOCS1O15524 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOCS1O15524 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOCS1O15524 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOCS1O15524 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOCS1O15524 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOCS1O15524 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOCS1O15524 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOCS1O15524 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOCS1O15524 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOCS1O15524 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOCS1O15524 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOCS1O15524 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms