Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GSC2O15499 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSC2O15499 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSC2O15499 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSC2O15499 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSC2O15499 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSC2O15499 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSC2O15499 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSC2O15499 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSC2O15499 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSC2O15499 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSC2O15499 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSC2O15499 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSC2O15499 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSC2O15499 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSC2O15499 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSC2O15499 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSC2O15499 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSC2O15499 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSC2O15499 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSC2O15499 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSC2O15499 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSC2O15499 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSC2O15499 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSC2O15499 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GSC2O15499 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSC2O15499 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSC2O15499 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSC2O15499 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSC2O15499 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSC2O15499 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSC2O15499 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSC2O15499 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSC2O15499 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSC2O15499 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSC2O15499 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSC2O15499 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSC2O15499 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSC2O15499 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSC2O15499 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSC2O15499 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSC2O15499 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GSC2O15499 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSC2O15499 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSC2O15499 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSC2O15499 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSC2O15499 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSC2O15499 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSC2O15499 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSC2O15499 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSC2O15499 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSC2O15499 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSC2O15499 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSC2O15499 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSC2O15499 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSC2O15499 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSC2O15499 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSC2O15499 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSC2O15499 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSC2O15499 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSC2O15499 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSC2O15499 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSC2O15499 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSC2O15499 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSC2O15499 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSC2O15499 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSC2O15499 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GSC2O15499 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSC2O15499 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSC2O15499 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSC2O15499 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GSC2O15499 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GSC2O15499 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GSC2O15499 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSC2O15499 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSC2O15499 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSC2O15499 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSC2O15499 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSC2O15499 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSC2O15499 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSC2O15499 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSC2O15499 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSC2O15499 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSC2O15499 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSC2O15499 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSC2O15499 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GSC2O15499 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSC2O15499 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSC2O15499 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSC2O15499 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSC2O15499 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSC2O15499 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSC2O15499 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSC2O15499 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSC2O15499 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSC2O15499 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSC2O15499 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GSC2O15499 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSC2O15499 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSC2O15499 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms