Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHADO15335 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHADO15335 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHADO15335 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHADO15335 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHADO15335 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHADO15335 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHADO15335 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHADO15335 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHADO15335 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHADO15335 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHADO15335 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHADO15335 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHADO15335 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHADO15335 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHADO15335 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHADO15335 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHADO15335 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHADO15335 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHADO15335 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHADO15335 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHADO15335 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHADO15335 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHADO15335 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHADO15335 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHADO15335 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHADO15335 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHADO15335 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHADO15335 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHADO15335 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHADO15335 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHADO15335 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHADO15335 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHADO15335 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHADO15335 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHADO15335 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CHADO15335 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHADO15335 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHADO15335 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHADO15335 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHADO15335 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHADO15335 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHADO15335 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHADO15335 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHADO15335 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHADO15335 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHADO15335 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHADO15335 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHADO15335 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHADO15335 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHADO15335 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHADO15335 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHADO15335 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHADO15335 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHADO15335 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHADO15335 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHADO15335 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHADO15335 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHADO15335 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHADO15335 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHADO15335 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHADO15335 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHADO15335 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHADO15335 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHADO15335 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHADO15335 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHADO15335 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHADO15335 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHADO15335 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHADO15335 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHADO15335 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHADO15335 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHADO15335 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHADO15335 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHADO15335 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHADO15335 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHADO15335 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHADO15335 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHADO15335 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHADO15335 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHADO15335 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHADO15335 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHADO15335 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHADO15335 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHADO15335 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHADO15335 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHADO15335 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHADO15335 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHADO15335 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHADO15335 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHADO15335 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHADO15335 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHADO15335 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHADO15335 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHADO15335 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHADO15335 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHADO15335 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHADO15335 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHADO15335 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHADO15335 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms