Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MATN3O15232 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MATN3O15232 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MATN3O15232 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MATN3O15232 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MATN3O15232 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MATN3O15232 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MATN3O15232 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MATN3O15232 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MATN3O15232 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MATN3O15232 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MATN3O15232 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MATN3O15232 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MATN3O15232 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MATN3O15232 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MATN3O15232 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MATN3O15232 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MATN3O15232 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MATN3O15232 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MATN3O15232 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MATN3O15232 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MATN3O15232 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MATN3O15232 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MATN3O15232 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MATN3O15232 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MATN3O15232 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MATN3O15232 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MATN3O15232 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN3O15232 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN3O15232 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN3O15232 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN3O15232 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN3O15232 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN3O15232 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN3O15232 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN3O15232 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN3O15232 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MATN3O15232 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MATN3O15232 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MATN3O15232 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MATN3O15232 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MATN3O15232 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MATN3O15232 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MATN3O15232 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MATN3O15232 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MATN3O15232 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MATN3O15232 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MATN3O15232 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MATN3O15232 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MATN3O15232 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MATN3O15232 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MATN3O15232 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MATN3O15232 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MATN3O15232 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MATN3O15232 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MATN3O15232 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MATN3O15232 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MATN3O15232 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MATN3O15232 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MATN3O15232 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MATN3O15232 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MATN3O15232 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MATN3O15232 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MATN3O15232 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MATN3O15232 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MATN3O15232 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MATN3O15232 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MATN3O15232 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MATN3O15232 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MATN3O15232 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MATN3O15232 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MATN3O15232 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MATN3O15232 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MATN3O15232 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MATN3O15232 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MATN3O15232 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MATN3O15232 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MATN3O15232 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MATN3O15232 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MATN3O15232 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MATN3O15232 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MATN3O15232 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MATN3O15232 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MATN3O15232 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MATN3O15232 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MATN3O15232 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MATN3O15232 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MATN3O15232 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MATN3O15232 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MATN3O15232 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MATN3O15232 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MATN3O15232 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MATN3O15232 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MATN3O15232 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN3O15232 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN3O15232 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN3O15232 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN3O15232 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN3O15232 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN3O15232 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms