Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN9O14815 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN9O14815 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN9O14815 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms