Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KPNA3O00505 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KPNA3O00505 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KPNA3O00505 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms